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【专题】基因组学技术专题(二)—— 为什么说FPKM/RPKM是错的

经验分享YellowTree 发表了文章 • 15 个评论 • 8780 次浏览 • 2015-08-25 00:42 • 来自相关话题

RNA-seq-COVER.png

【声明】本文未经许可,禁止转载!
两周前,我接触了一个RNA-seq的项目,做完之后,我重新思考了FPKM和RPKM的计算,觉得它们很可能是不对的,后来查阅了一些文献终于验证了我的想法。现在我重新将这个过程...
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为什么说RNA-seq的read分布会服从负二项分布?

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生物信息huangshujiabgi 发起了问题 • 1 人关注 • 0 个回复 • 1046 次浏览 • 2015-08-21 17:48 • 来自相关话题

pysam.TabixFile 读取VCF文件的IO速度是PyVCF的180倍,真是惊人的差别!

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软件使用YellowTree 发起了问题 • 1 人关注 • 0 个回复 • 778 次浏览 • 2015-08-20 11:42 • 来自相关话题

illumina的新测序仪中,Hiseq 3000 和Hiseq 4000 的数据产量和质量是怎么样的?

测序与实验YellowTree 回复了问题 • 2 人关注 • 1 个回复 • 877 次浏览 • 2015-08-19 22:59 • 来自相关话题

RNA-Seq中,RPKM是如何计算的?它和FPKM的区别又是什么?两者该如何选择?

问答互助huangzhuming 回复了问题 • 2 人关注 • 2 个回复 • 11335 次浏览 • 2015-08-25 16:11 • 来自相关话题

【专题】基因组学技术专题(一)——测序技术

经验分享YellowTree 发表了文章 • 0 个评论 • 3661 次浏览 • 2015-08-11 22:10 • 来自相关话题

【声明】本文未经许可,禁止转载!
这是以前我发在自己博客上的一篇文章(已被各种形式地转载了非常多次),虽然已是旧文,但做了些修改之后还是打算将其作为“基因组学技术分享”这个系列的开头,就如同测序是基因组学研究与发展的开头一样。

这个故事要从1977年Sang...
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FPKM与RPKM的区别和结果差异是什么

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问答互助huangshujiabgi 发起了问题 • 1 人关注 • 0 个回复 • 502 次浏览 • 2015-08-11 20:24 • 来自相关话题

如何才能生成一份可以使用tabix查看的文件

软件使用YellowTree 回复了问题 • 2 人关注 • 1 个回复 • 1325 次浏览 • 2015-08-11 10:54 • 来自相关话题

GATK 中Inbreeding Coefficient(近交系数)是如何计算的

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变异检测YellowTree 回复了问题 • 1 人关注 • 1 个回复 • 1346 次浏览 • 2015-08-11 20:45 • 来自相关话题

关于Tangram计算Genotype的核心方法

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变异检测YellowTree 回复了问题 • 1 人关注 • 1 个回复 • 814 次浏览 • 2015-08-11 09:51 • 来自相关话题