为什么Y染色体的组装质量比较差?

人类基因组上的Y染色体本身并不长啊,我看最新的GRCH38 参考序列,算了一下也就大约57Mb的样子。但是缺发现它的和其它的常染色体或者和同为性染色体的X染色体相比,Y的组装序列都很差。。整个染色体竟然接近一半(50%)的序列都是N。。。 不太明白这是为啥,仅仅只是因为重复序列的缘故吗?如果说是重复序列导致的话,其它染色体也有重复序列为什么它们却看起来没那么差呢?
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