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【专题】基因组学技术专题(二)—— 为什么说FPKM/RPKM是错的

经验分享YellowTree 发表了文章 • 17 个评论 • 15049 次浏览 • 2015-08-25 00:42 • 来自相关话题

RNA-seq-COVER.png

【声明】本文未经许可,禁止转载!
两周前,我接触了一个RNA-seq的项目,做完之后,我重新思考了FPKM和RPKM的计算,觉得它们很可能是不对的,后来查阅了一些文献终于验证了我的想法。现在我重新将这个过程...
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【专题】基因组学技术专题(一)——测序技术

经验分享YellowTree 发表了文章 • 0 个评论 • 5026 次浏览 • 2015-08-11 22:10 • 来自相关话题

【声明】本文未经许可,禁止转载!
这是以前我发在自己博客上的一篇文章(已被各种形式地转载了非常多次),虽然已是旧文,但做了些修改之后还是打算将其作为“基因组学技术分享”这个系列的开头,就如同测序是基因组学研究与发展的开头一样。

这个故事要从1977年Sang...
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【分享】目前最好最完整的SOAPdenovo使用说明

软件使用YellowTree 发表了文章 • 1 个评论 • 9049 次浏览 • 2015-07-09 23:57 • 来自相关话题

本文未经许可,禁止转载!
这是一份关于基因组组装软件SOAPdenovo的使用说明,内容包括了程序使用、参数的详细说明、参数如何调整、各个主要输出文件的格式说明等。

简介:
 
SOAPdenovo...
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【推荐】如何使用MACS获得ChIP-Seq富集的区域(峰区域)

软件使用fungenomics 发表了文章 • 0 个评论 • 5352 次浏览 • 2015-06-18 09:56 • 来自相关话题

【声明】本文未经许可,禁止转载!
 一 简介 
随着测序技术的不断改进,染色质免疫共沉淀的高通量测序(ChIP-Seq)已广泛应用于研究基因组蛋白和DNA之间的相互作用...
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有没有什么免费下载文献资源的方法

经验分享Phoenix0823 回复了问题 • 11 人关注 • 9 个回复 • 4106 次浏览 • 2017-03-31 11:22 • 来自相关话题

【分享】Nature一作深度解读:人类基因组单倍体组装重要技术细节(三—七)

新技术YellowTree 发表了文章 • 1 个评论 • 2081 次浏览 • 2015-06-03 07:56 • 来自相关话题


【编者的话】[url=http://www.fungenom...
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【分享】Nature一作深度解读:人类基因组单倍体组装重要技术细节(一二)

新技术YellowTree 发表了文章 • 0 个评论 • 1251 次浏览 • 2015-05-28 08:06 • 来自相关话题

QQ20150528-1@2x.png

【编者的话】5月25日,《Nature Biotechnology》 发表了华大基因炎黄(YH)基因组单倍体组装的结果(De novo assembly of a haplotype-resolved human gen...
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使用de Bruijn graph组装基因组的时候,Kmer数为何必须是奇数呢

问答互助YellowTree 回复了问题 • 2 人关注 • 1 个回复 • 5936 次浏览 • 2015-06-05 00:39 • 来自相关话题

RNA-Seq中,RPKM是如何计算的?它和FPKM的区别又是什么?两者该如何选择?

问答互助huangzhuming 回复了问题 • 2 人关注 • 2 个回复 • 16845 次浏览 • 2015-08-25 16:11 • 来自相关话题

【顶】用户须知(新手必读)

社区公告admin 发表了文章 • 0 个评论 • 618 次浏览 • 2015-05-03 05:41 • 来自相关话题

关于泛基因的介绍、目标和组织形式请参见:http://www.fungenomics.com/page/about
 
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